Así, José Luis Trejo Montoya por fin acarició y se deleitó de la ‘copa’ más codiciada del balompié mexicano. Dirigió las 17 jornadas del Torneo Clausura 2006, lapso en el que consiguió siete juegos ganados, cuatro empates y mismo número de derrotas, para un saldo total de 33 goles a favor y 19 en contra y un acumulado de 31 puntos, suficientes para colocar al cuadro del Pachuca como líder general de la competencia.

Toda vez ubicado en la liguilla, enfrentó primero al Morelia, en cuartos de final; para la semifinal hizo frente a uno de los equipos de mayor jerarquía en México, las Chivas del Guadalajara, con quienes sufrieron de más para llegar hasta la final, en la que dieron cuenta del ‘benjamín’ San Luis, con un solitario gol de Richard Núñez.

En esta fase final obtuvo tres triunfos, dos derrotas y un empate, para un saldo de nueve goles a favor por siete en contra, y en la que el uruguayo Núñez sobresalió con cinco goles, siendo así el máximo romperredes de esta etapa, y en el que Trejo depositó su confianza al inicio de este torneo, luego de su corto paso por La Máquina del Cruz Azul.

José Luis Trejo incursionó en el futbol profesional con el Atlético Español y la UAG, equipos con los que fungió como jugador. Más tarde fue seleccionado para los Juegos Panamericanos de 1971 y los Olímpicos de Munich en 1972.

Ya fuera de las canchas, pero aún ligado al balompié, formó parte de la dirección deportiva del Necaxa en 1995, y posteriormente de las selecciones mexicanas Sub-20 y Sub-17, en 1998.

Como director técnico debutó el 5 de septiembre de 1998 bajo el mando de Toros Neza, en el Torneo de Invierno del año en mención, en un partido en el que perdió 2-5 frente a Tigres, con los Toros sólo estuvo en esa competencia. Más tarde tomó las riendas del Cruz Azul Hidalgo, de Primera ‘A’, con quienes consiguió el subcampeonato en el Verano ’99.

En 2000 se sentó en el banquillo de La Máquina de la Primera División. Con los celestes tuvo un paso trascendental, luego de haberlos llevado hasta la final de la Copa Libertadores de América 2001 frente al Boca Juniors, de Argentina, cotejo en el que perdió el título en la definición por penales.

Con el conjunto cruzazulino fue con el que consiguió mejores números en Primera División: 106 juegos dirigidos, con 44 ganados, 29 empates y 33 descalabros, para un global de 161 puntos y 184 goles a favor por 153 en contra.

En 2002 terminó relaciones con los celestes, y en 2003 decidió tomar el mando del novel equipo Jaguares de Chiapas, con quienes permaneció hasta el Clausura 2005, torneo en el que se enroló con los Tuzos del Pachuca, una transferencia polémica por dirigir a dos equipos distintos en la misma competencia.

Así, con los Tuzos ha dirigido 55 partidos, y ha conseguido 25 victorias, 17 empates y 13 tropiezos. En general, ha estado en el banquillo en 231 ocasiones en el máximo circuito del futbol mexicano hasta su último partido, la final del Clausura 2006, donde finalmente alcanzó la cúspide frente al San Luis, y qué mejor forma de hacerlo que en casa, en el estadio Hidalgo, con toda Pachuca en las gradas.